Currently I am designing a structural equation modeling (SEM) of soil food web. I am wondering how to fix a relationship between predator and prey in R language: predator → prey, prey → predator, or predator ↔ prey?
Para determinar las relaciones entre depredador y presa en un modelo de ecuaciones estructurales (MEE) en R, puedes seguir estos pasos:
1. **Definición de Hipótesis**: Primero, necesitas formular tus hipótesis sobre las relaciones. Las posibles relaciones son:
- **Depredador → Presa**: Los depredadores afectan a la población de presas.
- **Presa → Depredador**: Las presas afectan a la población de depredadores.
- **Depredador ↔ Presa**: Hay una relación bidireccional entre ambos.
2. **Recopilación de Datos**: Asegúrate de tener datos adecuados que reflejen las interacciones entre depredadores y presas. Esto puede incluir datos de abundancia, biomasa, o tasas de crecimiento.
3. **Análisis Correlacional**: Antes de construir el MEE, realiza análisis correlacionales para ver cómo se relacionan las variables. Puedes usar funciones como `cor()` en R para observar la correlación entre las poblaciones de depredadores y presas.
4. **Construcción del Modelo**:
- Usa paquetes como `lavaan` o `sem` para construir tu modelo de ecuaciones estructurales.
- Define las relaciones en el modelo especificando la dirección (o bidireccionalidad) que crees que existe entre las variables.
If you're looking to model predator-prey interactions in a soil food web, SEM might not be the best approach since everything loops and you're working with observed species abundances (I assume?). SEM assumes unidirectional, acyclic paths (unless you're do some very advanced modeling like two-stage least squares or longitudinal cross lagged panel models). Why not dynamic systems models, or typical Lotka-Volterra-models instead as they are better suited to capturing the bidirectional/cyclic relationships.
Carmen Lucia Gil Chiquillo , Thank you very much for your detailed answer. I will conduct the correlation analysis and the SEM under the biological and ecological context again following your suggestions.
Marius Ole Johansen , Thank you very much! I conducted the SEM analysis according to some studies published, which developed the SEM model from the soil food web. I will try the advanced modeling you suggested. Would you suggest any books or papers published on these modeling method?
¡Por supuesto! Aquí tienes algunas recomendaciones de libros y artículos que te serán útiles para entender mejor el modelado de ecuaciones estructurales (MEE) en ecología y en general:
### Libros:
1. **"Structural Equation Modeling with lavaan"** por Yves Rosseel
- Este libro es una excelente referencia para aprender sobre el uso del paquete `lavaan` en R, que es ampliamente utilizado para MEE. Explica los conceptos básicos y ofrece ejemplos prácticos.
2. **"Structural Equation Modeling: Concepts, Issues, and Applications"** por Rick H. Hoyle
- Un texto completo que cubre la teoría y la práctica de MEE, incluyendo aplicaciones en diversas disciplinas.
3. **"Ecological Models and Data in R"** por Benjamin M. Bolker
- Aunque este libro no se centra exclusivamente en MEE, ofrece una buena introducción a modelos estadísticos en ecología utilizando R, lo que puede ser útil para tu investigación.
### Artículos:
1. **Grace, J. B., & Pugesek, B. H. (1997). "A Structural Equation Model of the Relationship Between Plant Diversity and Ecosystem Function."** *Ecology*.
- Este artículo utiliza MEE para explorar la relación entre la diversidad de plantas y el funcionamiento del ecosistema, proporcionando un buen ejemplo de aplicación en ecología.
2. **Shipley, B. (2000). "A New Inferential Method for Path Analysis: The Structural Equation Model."** *Ecology*.
- Este artículo presenta un enfoque novedoso para el análisis de caminos usando MEE, lo que puede ser relevante para tus estudios sobre redes tróficas.
3. **Bollen, K. A., & Noble, M. D. (2011). "Structural Equation Models and the Study of Social Networks."** *Social Networks*.
- Aunque se centra más en redes sociales, este artículo proporciona una base sólida sobre MEE y cómo se pueden aplicar a diferentes contextos.
4. **Grace, J. B., et al. (2010). "The Use of Structural Equation Modeling to Assess Ecosystem Functioning."** *Ecological Applications*.
- Este artículo discute cómo los modelos de ecuaciones estructurales pueden ser aplicados para evaluar el funcionamiento de los ecosistemas, ideal para tu interés en redes tróficas.
Estos recursos te proporcionarán una base sólida tanto teórica como práctica sobre el modelado de ecuaciones estructurales y su aplicación en ecología. ¡Espero que te sean útiles! Si necesitas más información o algo específico, no dudes en decírmelo.
terimakasih atas pertanyaannya, jadi maaf untuk membuat model yang lebih akurat maka skala pengukurannya dengan skala ordinal berbasis kinerja, jika sebelumnya menggunakan skala likert