I have cytokine measurements from 3 different conditions:
What is the best way of comparing the differences between the conditions ?
Many thanks
Irina
If you have 3 conditions won't that be a OneWay ANOVA with post-hoc tests?
Unless you have time points too.. than it would be a TwoWay ANOVA.
If you do a study per diet one way anova otherwise if you want all your data together two way standard anova with multiple comparisons as post hoc test
I think you can try to apply the approach adopted in the theory of management. Then the age of the mouse and the type of diet can be considered as factors. The values of these factors (different age, different diet) affect the cytokine content in mice. Each value of each factor has a certain sign and a certain force of influence on the content of cytokines. In the Eidos system (my development, open source software), it is easy to build models that reflect this influence. But to build models, you need empirical data. They can be represented as observations (rows) in an Excel table. When models are built is determined by the reliability of the F-criterion of van Rijsbergen. The most reliable model is selected and it solves the problems of identification, forecasting, decision-making and research of the subject area. In particular, cognitive cluster and SWOT analysis is performed. It gives you the information that interests you. I can help you develop and analyze these knowledge models. I have a lot of work on the application of intelligent technologies in various subject areas. If you wish, I can help you with this research. An example of a complete system-cognitive analysis is given in the paper:
Technical Report Ask-analysis of the impact of the space environment on seism...
and a number of other papers.
Я думаю можно попробовать применить подход, принятый в теории управления. Тогда возраст мыши и вид диеты можно рассматривать как факторы. Значения этих факторов (разный возраст, разная диета) оказывают влияние на содержание цитокинов у мышей. Каждое значение каждого фактора имеет определенный знак и определенную силу влияния на содержание цитокинов. В системе Эйдос (моя разработка, открытое программное обеспечение) несложно построить модели, отражающие это влияние. Но для построения моделей нужны эмпирические данные. Их можно представить в виде наблюдений (строки) в Excel-таблице. Когда модели построены определяется их достоверность по F-критерию Ван Ризбергена. Выбирается наиболее достоверная модель и в ней решаются задачи идентификации, прогнозирования, принятия решений и исследования предметной области. В частности проводится когнитивный кластерный и SWOT-анализ. Он дает ту информацию, которая вас интересует. Я могу помочь с разработкой и анализом этих моделей знаний. У меня много работ по применению интеллектуальных технологий в различных предметных областях. Если у Вас будет желание я могу Вам помочь с этим исследованием. Пример полного системно-когнитивного анализа приведен в работе:
Technical Report Ask-analysis of the impact of the space environment on seism...
и ряде других работ.