Dear David Esteban Duarte

Pls. find the attached files

https://www.researchgate.net/profile/Harold_Duban_Ardila_Barrantes/publication/262665954_Polyphenoloxidase_and_beta-13-Glucanase_Differential_Induction_in_Carnation_(Dianthus_caryophyllus)_Infectedby_Fusarium_oxysporum_f._sp._dianthi_race_2/links/5512d3c20cf270fd7e33880f.pdf

http://scholar.google.nl/citations?user=ydWuLWYAAAAJ&hl=en

http://www.javeriana.edu.co/biblos/tesis/ciencias/tesis293.pdf

https://en.wikipedia.org/wiki/Fusarium_oxysporum_f.sp._cubense

http://orbi.ulg.ac.be/bitstream/2268/79210/1/2010MtgAbstracts.pdf

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4103527/

Hoping this will be helpful

Regards

Prof. Houda Kawas

Article Polyphenoloxidase and β-1,3-Glucanase Differential Induction...

Also

And

 Estimado Esteban,

Considero que la identificación de razas fisiológicas via metodología molecular no debe ser el primer paso a seguir. Es importante que primero se intente hacer por la vía convencional, de evaluación de diferentes genotipos de lulo, que no se en este momento que tanto este identificado al respecto. La respuesta diferencial de diferentes genotipos de lulo a diferentes aislados del patógeno, podría ser un indicativo de la posible presencia de razas fisiológica o patotipos del hongo. Es importante saber en cada genotipo si existen o no diferentes genes de resistencia al patógeno, que determinen una respuesta diferencial a los diferentes aislados del patógeno.

Cordial saludo

The molecular characterization will provide information related to possible groups of populations of the pathogen, for this purpose would have to perform zonal sampling depending on the distribution of the host. The idea that the colleague Afanador establishes is accurate, since if it is done we could identify variants of the pathogenicity of the isolates as a function of the aggressiveness of the same ones on the host in study.

Gracias a todos por sus valiosos aportes y colaboración. Vale la pena que aclare algunas metodologías que están inmersas en este estudio.

El nombre completo del proyecto es "CARACTERIZACION MOLECULAR Y PATOGENICA DE RAZAS DE Fusarium oxysporum f. sp. quitoense CAUSANTES DEL MARCHITAMIENTO VASCULAR DEL LULO Solanum quitoense Lam. EN EL DEPARTAMENTO DE NARIÑO". 

OBJETIVOS ESPECIFICOS

-       Identificar razas de Fusarium oxysporum f. sp quitoense mediante la técnica molecular AFLPs (Polimorfismos en la Longitud de los Fragmentos Amplificados).

 -       Determinar la variabilidad patogénica de las dos razas más agresivas de Fusarium oxysporum f. sp. quitoense en genotipos de lulo (Solanum quitoense L).

Según estos dos objetivos me han planteado algunos cuestionamientos que me hacen dudar si lo planteado en metodología alcanza para obtener los resultados esperados.

1) La metodología o herramienta molecular que permite diferenciar entre razas de un patógeno necesita estudios previos, como son: variedades susceptibles y resistentes, primers específicos y secuencias reconocidas de las razas. Todo esto para poder identificarlas. Estos estudios para la forma especial quitoense aun no se han realizado.

2) Por otro lado, la metodología de AFLPs es muy costosa y complicada de trabajar, por ende me recomendaron trabajar con ITS o SSR, Esto para realizar una identificación de la variabilidad genética y las especies de fusarium que puedo encontrar en los aislamientos (45 en total de diferentes zonas geográficas del departamento de Nariño), mas no para identificación de razas como tal. 

Lo que plantea la Doctora Afanador me parece muy coherente, es mas, como lo menciono anteriormente, un objetivo esta enfocado en la caracterización patogénica de los aislamientos mas agresivos (esto por cuestión de tiempo y recursos, no puedo realizar la caracterización de todos los 45 aislamientos). 

De antemano agradezco enormemente su colaboración.

It is very good project

Best of luck

Houda

Technical Manual

Prevention and diagnostic of Fusarium Wilt

(Panama disease) of banana caused by

Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical

Race 4 (TR4)

Luis Pérez-Vicente PhD.

Senior Plant Pathologist, INISAV, Ministry of Agriculture, Cuba.

Expert Consultant on Fusarium wilt disease of banana

http://www.fao.org/fileadmin/templates/banana/documents/Docs_Resources_2015/TR4/13ManualFusarium.pdf

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Hi Duarte

I think, you can identify the races dependence on VCG, after you determine the race

you can do molecular biology