I have 4 files from different genes (ITS, TEF1, TUB2, RPB2) and need to concatenate aligned sequences from around 35 strains in order to make a pnylogenetic tree. Is the a software available for this or any other way?
Καλησπέρα Σταύρο, μπορείς να χρησιμοποιήσεις το MEGA-X που διατίθεται δωρεάν, θα πρέπει να δημιουργήσεις 4 φακέλους στον υπολογιστή σου όπου σε κάθε ένα φακελο θα βάλεις τα αντίστοιχα σετ αλληλουχιών (φάκελοι ITS, TEF1, TUB2 και RPB2). Μεγάλη προσοχή, τα ονόματα για τα 35 strains να είναι ακριβώς τα ίδια σε κάθε γενετική περιοχή που έχεις αναλύσεi. Για το πρόγραμμα αυτό και αυτήν την ανάλυση μπορείς να βρεις και αρκετά tutorials step-by-step από συναδέλφους στο youtube, στο πως να τρέξεις την ανάλυση. Γενικά είναι ιδιαίτερα εύχρηστο και φιλικό στο χρήστη.