I working with tarantulas and have few specimens collected by location, some are different species (most). I would like to work with some diversity index but most use many samples of individuals of the same species, in my case, I have
1-2 individuals per species per location usually, 5 maximum.
Any advice?
Que tal Rodolfo
Te diré que en lo particular he asesorado solo un trabajo, y en el caso de Moctezuma, Sonora, ubicamos algunos puntos de muestreo pero en cuanto al numero de individuos los consideramos de acuerdo a la disponiblidad. Ya que habia muy pocos y teniamos que aprovechar todos los que pudieramos rescatar.
Eres profesor o estudiante?
Atte. Héctor Mojica
Saludos Hector.
Soy estudiante de posgrado. Realmente queria saber si era valido (o factible) utilizar algun indice con los pocos animales ya colectados.
Estimado Rodolfo ¿Tienes réplicas espaciales y/o temporales de las colectas? En ese caso podrías calcular la ocupación y la probabilidad de detección por especie. Las herramientas más adecuada serían R y JAGS (para el análisis MCMC). En esta página del USGS puedes encontrar cursos y muchos ejemplos que pueden ser de utilidad: http://www.mbr-pwrc.usgs.gov/workshops/
It depends if you are trying to apply alpha-diversity (diversity at specific locations) or beta-diversity (the turnover of the fauna between different locations).
For alpha, I think the Simpson index is useful.
For beta, I would recommend the Bray-Curtis index.
Keep in mind that many studies use presence-absence format, therefore the biggest number is one! Nevertheless, these studies can still be useful. Therefore, don't be too concerned about your low numbers.
Gracias a todos.
Jose Jimenez: No cuento con replicas espaciales temporales, por desgracia solo son organismos provenientes de una unica salida a las distintas zonas de colecta. Muchasgracias por la informacion, la revisare.
Michael Reuscher: Thanks for the advice, I had planned to use both, but I was very concerned by the number of individuals, but now that you mention it, maybe I can base it on presence absence .
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