When I test the deficit or excess of heterozygous by software Genepop I have a result with P-value, and Fis W§K Fis R$h, unfortunately the results of the two values of Fis are contradictory. Therefore I based my interpretation on the values of P-value or Fis?
What do you mean by contradictory? If it P-value for HW and for Fis, you may expect to have some differences, as the tests are not the same. However if you find significant positive Fis and significant heterozygote excess, then indeed you may have a problem.
One solution could be indeed to check results with other software...
I definately urge you to check it with other software, e.g. Arlequin.
They both are different things. You might assume deviation from HWE related to FIS at a locus. The only good thing to do for testing the deficit or excess of heterozygous is to use other recommended software.
Good luck
bonsoir samir
en ce qui concerne le paramètre Fis (différenciation de l'individu en sein d'uns sous population) 'coefficient de wreight ou de consanguinité), un autre paramètre Fit indiquant la différenciation de l'individu par rapport a la population totale), Fil (différenciation de l’individu par rapport à la localité) en se basant toujours sur la divergence des population, principe conduisant par la suite à la spéciation 'apparition et fixation d'un nouveau caractère chez un individu de la mème population au fil des génération. si vous avez un déficit en hétérozygote logiquement vous aurez une augmentation dans l’homozygotie. pour l'interprétation des résultats en se basant sur les valeurs F, vous avez des intervalles de variation allant d'une faible différenciation, différenciation modérée vers une forte différenciation. maintenant l'écart par rapport a la loi de HW, une loi fictive qui reflète une population idéale, si vous avez un écart donc l'une des forces évolutives (sélection ,mutation, migration ou dérive génétique) présente un effet et déstabilise la structure génétique de la population en question.
bon courage.
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